Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C3

Alg13, Putative bifunctional UDP-N-acetylglucosamine transferase and deubiquitinase ALG13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alg13Q9D8C3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Alg13Q9D8C3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Alg13Q9D8C3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Alg13Q9D8C3 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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