Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubb4aQ9D6F9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tubb4aQ9D6F9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms