Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Ubxn11Q9D572 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ubxn11Q9D572 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms