Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PrameQ9D4Z5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PrameQ9D4Z5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PrameQ9D4Z5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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PrameQ9D4Z5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PrameQ9D4Z5 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms