Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efhd1Q9D4J1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Efhd1Q9D4J1 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms