Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tubgcp4Q9D4F8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms