Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rufy3Q9D394 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Rufy3Q9D394 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms