Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Trim42Q9D2H5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim42Q9D2H5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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