Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thumpd2Q9CZB3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms