Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Lhfpl3Q9CTN8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms