Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS72

Filip1, Filamin-A-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Filip1Q9CS72 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Filip1Q9CS72 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Filip1Q9CS72 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms