Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Smim8Q9CQQ0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Smim8Q9CQQ0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms