Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pramel1Q99MW3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms