Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Clp1Q99LI9 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Clp1Q99LI9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms