Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TrabdQ99JY4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TrabdQ99JY4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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TrabdQ99JY4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TrabdQ99JY4 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TrabdQ99JY4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TrabdQ99JY4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
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TrabdQ99JY4 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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TrabdQ99JY4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TrabdQ99JY4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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