Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Kdelr1Q99JH8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms