Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ddb2Q99J79 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ddb2Q99J79 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ddb2Q99J79 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ddb2Q99J79 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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