Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
SptssbQ925E8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 4931406P16Rik-202ENSMUST00000108074 6224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
SptssbQ925E8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms