Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms1Q8VCQ6 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sgms1Q8VCQ6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sgms1Q8VCQ6 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sgms1Q8VCQ6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sgms1Q8VCQ6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgms1Q8VCQ6 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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