Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
LINC00612Q8N6U2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms