Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pitrm1Q8K411 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pitrm1Q8K411 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms