Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Snx8Q8CFD4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Snx8Q8CFD4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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