Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

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Length 928 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bcas3Q8CCN5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Bcas3Q8CCN5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Bcas3Q8CCN5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Bcas3Q8CCN5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Bcas3Q8CCN5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bcas3Q8CCN5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms