Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp20Q8C6M1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Usp20Q8C6M1 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Usp20Q8C6M1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Usp20Q8C6M1 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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