Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cnot2Q8C5L3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms