Protein–RNA interactions for Protein: Q8BRE0

Rd3, Protein RD3, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3Q8BRE0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rd3Q8BRE0 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rd3Q8BRE0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms