Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR07

Bicd1, Protein bicaudal D homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bicd1Q8BR07 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Bicd1Q8BR07 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms