Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY2

Tarsl2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarsl2Q8BLY2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tarsl2Q8BLY2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms