Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Tubgcp5Q8BKN5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tubgcp5Q8BKN5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Tubgcp5Q8BKN5 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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