Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH02

Tor4a, Torsin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tor4aQ8BH02 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tor4aQ8BH02 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tor4aQ8BH02 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms