Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Lrrtm2Q8BGA3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms