Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc50Q810U5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc50Q810U5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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