Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrc1Q80VQ1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrc1Q80VQ1 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms