Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Polr2eQ80UW8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms