Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sestd1Q80UK0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms