Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clec18aQ7TSQ1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms