Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Dsg1cQ7TSF0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Dsg1cQ7TSF0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms