Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM9

Tubb2a, Tubulin beta-2A chain, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb2aQ7TMM9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tubb2aQ7TMM9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubb2aQ7TMM9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms