Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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