Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atg16l2Q6KAU8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atg16l2Q6KAU8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms