Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Vat1Q62465 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Vat1Q62465 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms