Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Aldh1a2Q62148 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Aldh1a2Q62148 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms