Protein–RNA interactions for Protein: Q61660

Foxj1, Forkhead box protein J1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxj1Q61660 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Foxj1Q61660 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxj1Q61660 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxj1Q61660 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms