Protein–RNA interactions for Protein: Q61646

Hp, Haptoglobin, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpQ61646 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HpQ61646 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HpQ61646 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HpQ61646 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HpQ61646 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
HpQ61646 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HpQ61646 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HpQ61646 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms