Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim25Q61510 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim25Q61510 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim25Q61510 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim25Q61510 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms