Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Pde1aQ61481 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pde1aQ61481 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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