Protein–RNA interactions for Protein: Q60949

Tbc1d1, TBC1 domain family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d1Q60949 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tbc1d1Q60949 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tbc1d1Q60949 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms