Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Grik1Q60934 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Grik1Q60934 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms