Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tcf4Q60722 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tcf4Q60722 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms