Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prdm1Q60636 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Prdm1Q60636 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms